国家税务机关建立了税务案件协查管理制度，外地税务机关可以要求当地税务机关对管辖范围内企业协助检查，以帮助外地税务机关低成本调查取证，以便外地税务机关尽快结案。因此，某一天，企业的主管税务机关通知要进场进行协助调查，财务人员应该不必惊讶，这种协查现在经常发生。
税总发[2016]84号 国家税务总局关于印发《国家税务局 地方税务局联合稽查工作办法（试行）》的通知
税务机关要来协查，企业应该怎么办？
1分清是供应商还是销售客户涉及检查
发出协查要求的可能是企业的供应商，也可能是企业的销售客户。如果是供应商，与采购业务相关，重点问题是采购发票。如果是销售客户，与销售相关，主要是销售开具的发票是否合规。先了解清楚对象，分清性质非常重要。
2尽快联系对方，了解背景
了解清楚以后，应尽快与对方企业取得联系。第一时间确定：是否对方应该失踪跑路了。如果涉案供应商跑路，可能企业取得的进项发票不能抵扣，问题比较严重。如果不涉及对方跑路，双方比较容易沟通，解决问题就比较容易。企业需要了解对方是什么背景、类别的税务检查，税务机关提出的疑问是什么等。
3复核商业文件，确定是否违规
了解背景以后，企业需要调出相关业务文件，从业务合同、协议、订单、发货单、出仓单、运输单据、银行水单到发票等全部审核一遍，分析业务的税务处理是否合规，如果存在违规，应分析违规的性质，可能涉及的法律责任等。
4合理解释业务瑕疵
协查中比较常见的情况是：没有委托，但业务处理存在瑕疵。需要提醒企业：瑕疵不等于违规，并不需要涉及较大的法律责任，很多企业不明就里，被税务机关抓住业务处理的某项瑕疵被追缴补税，实在冤枉。
5是否涉及其他业务
如果存在税务违规，必须迅速判断是否涉及其他类似业务。例如：经协查确定，某供应商开具的是假发票，企业需要马上分析与供应商的其他业务交易，看是否都涉及假发票问题。
6采取补救措施
不管是瑕疵还是违规，企业都需要采取补救措施，对今后的同类业务应该纠错，及时调整处理方法，避免今后再犯。对于之前发生的错误， 应根据情况分析可能的法律责任，分析是否存在应该由对方公司承担责任的情况，是否存在某些其他特殊情况。
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