费改税的好处如下所示：
1.实行费改税可以提高财政收入，增强政府对国民收入的宏观调控能力。由于收费基金的存在，国家用于可支配的资金不足，财政困境很难得到缓解。又由于收费项目的混乱，导致大量的收费流入国民收入分配领域，多数部门也进行到国民收入分配，参与分配，这些部门分散了政府资金，政府的支配权削弱。很多单位以收费进行开支，比如公路收费中大部分管理人员都是依靠收费来进行花销的，还有环保部门、工商部门也是如此。因此，实行费改税，可以将地方部门的零散收入纳入到财政轨道上来，国家能够集中分散的资金，支持经济和社会事业的发展，从整体上进行宏观调控。
2.实行费改税可起到惩治腐败的作用，建立高效廉洁的政府。在市场经济条件下，政府的收入主要是依靠税收，而现在的收费和基金项目的存在，减少了财政的收入，滋长了腐败现象，也有损党和政府的形象。在此种情况下实行费改税，是为了取消政府的灰色收入，将政府的收入纳入到轨道上来，这样可以增加财政可支配的收入。当然，对此国家要采取措施，改革政府机构，拨足经费，对公务员的工资实行合理的增长机制。实行费改税，限制政府的体制外收费，铲除产生腐败的条件，为建立高效廉洁的政府提供条件。
3.实行费改税可以减轻企业和农民等纳税人的负担。在政府强制收费的情况下，费就是权，费就是法律，收费比税还高，收费的部门也多，项目多，比如一个个体猪肉行，除了缴纳税收外，还要缴纳各种名目的收费，这种情况下，大大加重了纳税人的负担，引起了企业和纳税人的不满。实行费改税取消了不合理的收费，主要是取消一些没有法律依据的，各种乱收费，乱集资现象，这样既能减轻纳税人的负担，又能推动第三产业的发展。
4.实行费改税有利于依法治税。在当前的收费和基金中有相当一部分具有税收性质，可以纳入税收轨道。政府进行强制收取的基金，收费中，收入来源比较广泛，收入比较稳定，获得后具有无偿性的，都可以纳入税收。我国的税种都有着坚实的法律基础，有法可依，国家对此还成立了专门的征税机构，按照税法进行征税，公正透明度高，这样成本远远低于地方政府实行的各种名目的收费，减轻了纳税人负担。实行费改税，可以将各种不规范的收费，基金等纳入到轨道上来，在政府、企业和个人之见进行合理分配，这种分配又受到社会的监督，进行法制化和规范化的管理。
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